Ngoại trừ methyl mercaptan là khí ở nhiệt độ phòng, các mercaptan khác là chất lỏng hoặc chất rắn. Các phân tử thiol có sức hút dipole, nhưng ít hơn sức hút dipole giữa các phân tử rượu, và không có sự tạo liên kết hydro giữa các phân tử thiol, và không có sự liên kết rõ ràng. Do đó, điểm sôi của thiol cao hơn so với alkane có cùng trọng lượng phân tử, thấp hơn so với rượu có cùng trọng lượng phân tử, và tương tự như thioether có cùng trọng lượng phân tử.

Thiol không tạo ra liên kết hydrogen tốt với nước, vì vậy khả năng hòa tan của mercaptan trong nước nhỏ hơn nhiều so với rượu tương ứng. Ở nhiệt độ phòng, khả năng hòa tan của etanethiol trong nước chỉ là 1,5g/100mL.

Các mercaptan cấp thấp có mùi rất mạnh và khó chịu, và mùi của etanethiol đặc biệt nổi bật, vì vậy etanethiol thường được sử dụng như một chất cảnh báo trong khí tự nhiên để cảnh báo về rò rỉ khí tự nhiên. Tuy nhiên, khi trọng lượng phân tử tăng lên, mùi của mercaptan trở nên yếu đi, và mercaptan có hơn chín cacbon có mùi thơm.