Mercaptanlar kolayca oksitlenir. Zayıf bir oksitleyici (hava, iyot, demir oksit, mangan dioksit vb.) tiyolü bir disülfüre oksitleyebilir. Tiyol ve disülfür tarafından oluşturulan konjuge oksijen çifti, vücutta yaygın bir mekanizmadır, örneğin bir sistein-sistin-oksijen çifti. Oluşan disülfürdeki disülfür bağı, proteinin uzamsal yapısını korumada önemli bir rol oynar.

Merkapten güçlü bir oksitleyici madde (potasyum permanganat, nitrik asit, periyodik asit gibi) ile oksitlenir ve ara ürün sülfenik asit veya sülfenik asit üzerinden geçirilerek sonunda sülfonik asit oluşturulur. Bu yöntem, yağlı sülfonik asitlerin hazırlanması için kullanılabilir.

Merkezîleşdirilmiş merkaptanların katalitik hidrogenlənməsi desulfurizasiya etməyə və müvafiq hidrokarbonlar yaratmağa nail olur. Neft rafinasiyasında hidrodesulfurizasiya bu reaksiyaya əsaslanır. Neftdə az miktarda merkaptan var. Merkaptanın mövcudluğu benzinin narahat edici bir qoxuya malik olmasına səbəb olur və yandıqda zəhərli və korroziya yaradan sülfür dioksid və sülfür trioksidə çevrilir.