Exceto que o metil mercaptano é um gás à temperatura ambiente, outros mercaptanos são líquidos ou sólidos. As moléculas de tiol têm atração dipolar, mas são menores do que a atração dipolar entre as moléculas de álcool, e não há ligação de hidrogênio óbvia entre as moléculas de tiol, e não há associação óbvia. Portanto, o ponto de ebulição do tiol é mais alto do que o do alcano com peso molecular semelhante, mais baixo do que o do álcool com peso molecular semelhante e semelhante ao do tioéter com peso molecular semelhante.

O tiol não forma uma boa ligação de hidrogênio com a água, portanto, a solubilidade do mercaptano na água é muito menor do que a do álcool correspondente. À temperatura ambiente, a solubilidade do etanotiol na água é apenas 1,5g/100mL.

Os mercaptanos de baixa qualidade têm um odor forte e repugnante, e o odor do etanotiol é particularmente pronunciado, por isso o etanotiol é comumente usado como agente de aviso no gás natural para alertar sobre vazamentos de gás natural. No entanto, à medida que o peso molecular aumenta, o odor do mercaptano se torna mais fraco, e o mercaptano com mais de nove carbonos tem um odor agradável.