メチルメルカプタンは室温では気体である以外は、他のメルカプタンは液体または固体です。チオール分子は双極子引力を持っていますが、アルコール分子間の双極子引力よりも小さく、チオール分子間に明確な水素結合はなく、明確な結合はありません。したがって、チオールの沸点は、類似の分子量を持つアルカンよりも高く、類似の分子量を持つアルコールよりも低く、類似の分子量を持つチオエーテルと類似しています。

チオールは水と良い水素結合を形成しないため、メルカプタンの水溶性は対応するアルコールのそれよりもはるかに小さいです。室温では、エタンチオールの水に対する溶解度はわずか1.5g/100mLしかありません。

低級メルカプタンは強い不快な臭いがあり、エタンチオールの臭いは特に顕著です。そのため、エタンチオールは天然ガスの漏れを警告するための警告剤として一般的に使用されています。ただし、分子量が増加すると、メルカプタンの臭いは弱くなり、炭素が9つ以上のメルカプタンは心地よい臭いがします。