থায়লসে, সালফার পরমাণুটি একটি অসমান sp হাইব্রিড অবস্থানে আছে, যেখানে sp হাইব্রিডাইজেশন অর্বিটালগুলি দুটি একক ইলেক্ট্রন দ্বারা আবিষ্কৃত হয় এবং হাইড্রোকার্বাইল কার্বন এবং হাইড্রোজেন সাথে প্রতিষ্ঠিত একটি σ বন্ধু গড়ে, এবং আরেকটি দুটি sp হাইব্রিড অবস্থান অধিক দুটি লোন পেয়ার ধারণ করে। কারণ সালফারের 3s এবং 3p অর্বিটালগুলি দ্বারা গঠিত হাইব্রিড অর্বিটালগুলি ওজোনের 2s এবং 2p অর্বিটালগুলি গঠিত হাইব্রিড অর্বিটালগুলির চেয়ে বড়, তাই C-S এবং S-H বন্ধনগুলি C-O এবং O-H বন্ধনগুলির চেয়ে বেশি দীর্ঘ।

মিথাইল মার্কাপটানে C-S এবং S-H বন্ধন দৈর্ঘ্য ছিল 0.182 ন্যানোমিটার এবং 0.134 ন্যানোমিটার একইভাবে, যেগুলি মেথানলের C-O এবং O-H বন্ধনের চেয়ে বেশি ছিল। ∠CSH 96°, ∠COH এর চেয়ে কম।

সালফারের ইলেক্ট্রোনেগেটিভিটি অক্সিজেনের থেকে কম, তাই থাইল ডাইপোল মোমেন্টও সম্পর্কিত এলকোহলের চেয়ে ছোট।